Les Larmes d’Automne font le tour du monde à la suite de la quête de l’agent Paul Christopher pour prouver que les Sud-Vietnamiens sont derrière l’assassinat du président John F. Kennedy pour se venger du soutien de Kennedy au coup d’État de 1963.
L’agent Paul Christopher apprend d’un informateur, Luong, une rencontre entre un responsable nord-vietnamien et une femme non identifiée. Paul est à Paris avec son assistant social, Tom Webster, l’assistant de la Maison Blanche Dennis Foley et Peggy McKinney lorsque la nouvelle d’un coup d’État à Saigon arrive. Paul s’envole pour Rome pour rendre visite à sa petite amie Molly, puis pour Washington, DC, pour rencontrer un vieil ami et haut responsable de l’agence, David Patchen. Paul a rencontré au Congo Alphonse Nsango lorsque la nouvelle de l’assassinat de John F. Kennedy est tombée. De retour à Rome, Paul apprend la paranoïa soviétique parce que l’assassin Lee Harvey Oswald avait fait défection en URSS et entend Nguyên Kim, une connaissance de Saigon, parler de la détermination des ONG à « cracher de leurs tombes ». En dix jours, Paul formule une hypothèse.
Lorsque Foley ordonne la fin de l’enquête sur Paul, Paul démissionne. A Genève, il retire une grosse somme d’argent déposée à son nom, se rend à Paris, où Kim lui parle des liens familiaux vietnamiens, lui vend des noms de contacts et promet que « Lê Thu » « ouvrira les portes ». A Saigon, Paul visite le Truong toc, apprend de l’associé de Wolkowicz le voyage d’Oswald à Mexico, rencontre un énigmatique parent Ngo, le Père. Jean-Baptiste Ho, entend comment l’héroïne va piéger les jeunes soldats américains arrivant dans le comté, et retourne à Saigon pour retrouver Luong assassiné. Après un autre entretien avec le Truong toc, Paul est abattu et presque attaqué à la voiture piégée, arrêté et sommé de quitter le pays. Après avoir assisté au réveil de Luong, organisé les horoscopes de Yu Lung et tué par inadvertance les assassins de Luong, Paul attrape son avion.
De retour à Rome, Paul apprend du transfuge soviétique Gherman Klimenko l’existence de Frankie Pigeon, organise l’utilisation d’une villa de l’Agence, envoie Molly avec Websters en Suisse, obtient des traductions des horoscopes chinois, rencontre Kim, qui renouvelle la menace de mort de Truong toc contre Molly, obtient des preuves à Zurich confirmant l’histoire de Klimenko, engage Stavros Glavanis et Jan Eycken pour kidnapper Pigeon et extrait personnellement les aveux de Pigeon, qu’il s’envoie par courrier à Washington. De retour au Congo, Paul apprend l’embauche de Lee Harvey Oswald auprès du Cubain Manuel Ruiz, prépare un rapport final et le propose au gouvernement. Le nouveau supérieur de Foley à la Maison Blanche, JD Turnbull, le croit, mais le brûle par opportunisme politique. Paul retrouve Molly à Zermatt pour le réveillon du Nouvel An et accepte qu’elle ne le quittera pas, même au péril de sa vie.