Nous sommes à l’été 2021. Vous louez une maison à la campagne avec une bande d’amis pour l’anniversaire de quelqu’un. Le temps est magnifique ce week-end, donc la plupart du temps vous êtes tous dehors (piscine, foyer, hamac, etc.) mais vous dormez tous dans la même maison. Et puis mardi, vous recevez une alerte sur votre téléphone indiquant que vous avez été exposé au SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19. Quelle est la probabilité que vous l’ayez maintenant ?
Pour répondre à cette question, un groupe de statisticiens, de data scientists, d’informaticiens et d’épidémiologistes au Royaume-Uni a analysé 7 millions de personnes qui ont été informées qu’elles avaient été exposées au COVID-19 par l’application NHS COVID-19 en Angleterre et au Pays de Galles entre avril 2021. et février 2022. Ils voulaient savoir si – et comment – ces notifications d’applications étaient en corrélation avec la transmission réelle de la maladie. Des analyses comme celle-ci peuvent contribuer à garantir qu’une application conçue pour le prochain agent pathogène pourra conserver son efficacité tout en minimisant les charges sociales et économiques. Et cela peut nous en dire plus sur la dynamique de la transmission du SRAS-CoV-2.
Plus de 20 millions de demandes de quarantaine
L’application NHS COVID-19 était active sur 13 à 18 millions de smartphones par jour en 2021. Elle utilisait des signaux Bluetooth pour estimer la proximité entre ces smartphones tout en préservant la confidentialité, puis alertait les personnes qui passaient 15 minutes ou plus à une distance de 2 mètres ou moins d’un cas confirmé. Cela a donné lieu à plus de 20 millions d’alertes de ce type, chacune accompagnée d’une demande de mise en quarantaine – un fardeau considérable.
Les chercheurs ont découvert que l’application traduisait en fait avec précision la durée et la proximité d’une exposition au COVID-19 en un score de risque épidémiologique pertinent. L’application a évalué le risque d’un contact en multipliant la durée du contact, la proximité du contact et le caractère contagieux du cas index, déterminé par le temps écoulé depuis que le cas index a commencé à présenter des symptômes ou à avoir été testé positif.
La probabilité d’une infection signalée augmentait à mesure que le score de risque de l’application augmentait : davantage de contacts que l’application considérait comme présentant un risque de transmission élevé ont été testés positifs au COVID-19 dans les deux semaines suivantes que ceux qui avaient été informés mais avaient un risque de transmission plus faible. niveaux de risque. (Il s’agit de tests positifs qui ont été signalés en utilisant l’application. Certaines des personnes à haut risque n’ont probablement pas fait de test du tout, n’ont pas communiqué les résultats de leurs tests ou ne les ont pas signalés dans le délai imparti. Il s’agit donc d’une sous-estimation du corrélation entre la notification du risque et l’infection.)
Plus d’exposition = risque plus élevé
Lorsque les chercheurs ont séparé les facteurs contribuant au risque d’exposition, ils ont constaté que la durée était l’indicateur le plus important. Les expositions domestiques représentaient 6 pour cent de tous les contacts mais 41 pour cent des transmissions.
Une mise en garde : l’application n’a enregistré aucune variable contextuelle connue pour avoir un impact sur le risque de transmission, comme si les gens vivent dans une zone urbaine ou rurale, la réunion a-t-elle eu lieu à l’intérieur ou à l’extérieur, était-ce pendant la semaine ou le week-end, y avait-il quelqu’un ? vaccinés, etc. L’inclusion de ces données pourrait rendre l’évaluation des risques plus précise.
Sur la base de leurs travaux, les chercheurs suggèrent qu’une étape « Alerte Amber » aurait pu être introduite dans l’application, dans laquelle les personnes considérées comme présentant un degré de risque intermédiaire seraient invitées à passer un test PCR plutôt que de passer immédiatement en quarantaine. L’inclusion de cette population intermédiaire d’alerte Amber aurait pu réduire considérablement les coûts socio-économiques de la recherche des contacts tout en conservant son impact épidémiologique ou aurait pu augmenter son efficacité pour un coût similaire. Effectuer des analyses comme celle-ci au début de la prochaine pandémie pour déterminer comment elle se transmet pourrait minimiser la maladie et la pression sur la société.
Nature, 2023. DOI : 10.1038/s41586-023-06952-2