Taggerung est une histoire fantastique fictive sur un guerrier loutre nommé Deyna qui est enlevé à sa famille alors qu’il était bébé et élevé par une bande de vermine vicieuse. Élevé dans l’idée qu’il est le légendaire Taggerung annoncé dans les légendes du groupe de vermine, Deyna se rend compte qu’il est de plus en plus en contradiction avec leurs actions brutales. Il quitte le clan et se dirige vers l’abbaye de Redwall où il retrouve sa mère et sa sœur et où il aide les créatures de Redwall à se défendre contre le trésor de vermine qui le poursuit.
Taggerung s’ouvre dans le camp de Sawney Rath, un furet qui est le chef du clan Juska. Sawney kidnappe le bébé loutre Deyna, tuant son père. Tagg, comme on appelle la loutre, devient l’une des créatures les plus redoutées du clan. Il n’est pas assez vicieux pour plaire à Sawney, et quand Sawney insiste pour que Tagg tue un renard en fuite, Tagg le défie et s’enfuit. Il est traqué par une petite bande de Juska dont le lent d’esprit Gruven, une hermine dont la mère souhaite faire de lui le Taggerung.
Pendant ce temps, les créatures de l’abbaye de Redwall se régalent paisiblement entre leurs hauts murs. L’abbaye est dirigée par un vieux blaireau aveugle nommé Cregga qui prend la jeune loutre Mhera comme amie proche et l’observe avec l’idée d’élire Mhera comme abbesse. Mhera est en réalité la sœur aînée de Tagg, présumé mort.
En se déplaçant dans la nature, Tagg se lie d’amitié avec une souris nommée Nimbalo. Troublé par des rêves qui semblent concerner ses premiers souvenirs de Redwall, Tagg découvre l’abbaye grâce à Nimbalo et à d’autres créatures utiles qu’il rencontre. Il se dirige vers l’abbaye mais est capturé par certaines des créatures de Redwall qui croient qu’il fait partie du trésor de vermine.
Pendant ce temps, l’équipe de traque arrive également à Redwall et exige qu’ils remettent Tagg, dont sa mère a réalisé qu’il s’agissait de son fils perdu, Deyna. Deyna quitte l’abbaye et avec Nimbalo se précipite la vermine qui l’a poursuivi. Gruven s’enfuit effrayé, mais les deux dirigeants du parti sont tués. Deyna et le blaireau Cregga sont grièvement blessés.
Deyna récupère mais pas Cregga. Cependant, avant de mourir, elle nomme Mhera au poste d’abbesse. Gruven retourne dans son clan et prétend avoir tué le Taggerung. Il découvre que le clan a été repris par un renard nommé Ruggan Bor qui est sceptique quant aux affirmations de Gruven. Ruggan mène son clan jusqu’aux murs de Redwall dans un défi, mais il est encerclé à la dernière minute par une armée de lièvres venus aider à défendre l’abbaye. Ruggan se retire et Deyna reçoit l’épée spéciale de Martin le guerrier et nommée Guerrier de Redwall.