Meggie Folchart vit seule avec son père Mo, spécialiste de la réparation de livres. Sa mère a disparu quand Meggie était bébé. La visite nocturne d’un homme mystérieux nommé Dustfinger déclenche une série d’événements qui confrontent Meggie et son père au sinistre Capricorne. Alors qu’elle est emprisonnée par le méchant Capricorne, Meggie apprend le véritable destin de sa mère et la capacité secrète de son père à lire des personnages et des objets dans des livres et dans la vie réelle. Meggie apprend qu’elle a hérité des compétences spéciales de son père et ensemble, avec l’aide de Dustfinger, la grande tante de Meggie Elinor et Fenoglio, l’écrivain d’ Inkheart , ils battent Capricorne et Meggie retrouve sa mère.
La visite d’un mystérieux inconnu nommé Dustfinger, conduit le père de Meggie Folchart, Mo, à décider de fuir leur petite ferme et de se réfugier dans le domaine de la grand-tante de Meggie, Elinor. Sur le chemin d’Elinor, Meggie apprend de son père et de Dustfinger qu’ils fuient un homme maléfique nommé Capricorne, qui non seulement désire un objet longtemps possédé et caché par Mo, mais souhaite également employer de force Mo pour un talent mystérieux. Mo refuse de dire à Meggie quel pourrait être ce talent.
Une fois au domaine d’Elinor, qui pour le plus grand plaisir de Meggie est rempli de livres, Mo est trahi par Dustfinger, qui organise son enlèvement par les hommes de main de la veste noire de Capricorne. Cependant, les ravisseurs ne parviennent pas à trouver l’objet précieux, un livre appelé Inkheart, car il est en possession d’Elinor lorsque Mo est kidnappé. Dustfinger retourne au domaine sur les ordres de Capricorne et convainc Meggie et Elinor de tenter de sauver Mo du village caché de Capricorne dans les contreforts italiens.
Meggie et Elinor sont surprises en train de se faufiler dans le village et sont amenées devant Capricorne. Capricorn brûle des centaines d’exemplaires d’Inkheart, n’en conservant qu’un seul. Pendant son incarcération, Mo dit à Meggie et Elinor qu’il a une capacité spéciale à lire des personnages et des objets hors du livre et dans la vie réelle. Tout ce qui est lu de cette manière change de place avec un objet ou une personne qui se trouve à proximité lorsque Mo lit. C’est de cette manière que, la nuit où il a découvert que son talent s’étendait aux personnages de livres, Mo a accidentellement lu sa femme Theresa, la mère de Meggie, dans le livre intitulé Inkheart. En même temps, il a lu trois personnages du livre, le lâche interprète Dustfinger, le méchant Capricorne et Basta, le lieutenant en chef du Capricorne.
Mo, Meggie, Elinor et Dustfinger s’échappent du Capricorne et se rendent dans un village voisin où vit Fenoglio, l’auteur de Inkheart. Basta suit et reprend Meggie, avec Fenoglio. Dustfinger revient et tente de se faufiler dans le village et de voler la seule copie restante d’Inkheart à Capricorne, mais est contrecarré lorsque son conspirateur, une femme de chambre muette nommée Resa, est attrapé. En captivité, Meggie se rend compte qu’elle partage le cadeau de son père. Lorsque Capricorne apprend cela, il décide de lui faire lire son assassin préféré, l’Ombre, dans Inkheart. L’Ombre sera l’exécutif Dustfinger et la femme de chambre Resa, dont Meggie se rend compte qu’il s’agit en fait de sa mère, Theresa.
Meggie et Fenoglio retournent les tables sur le Capricorne en modifiant le texte que Meggie va lire et, alors que Mo met le feu au village avec l’aide d’un jeune homme nommé Farid qu’il a lu dans un autre livre, Meggie lit les lignes qui mettent fin au Capricorne.