Laissé pour compte est une histoire de transformation, de foi et de salut. Le monde est bouleversé lorsque des millions de personnes dans le monde disparaissent soudainement. Partout, les gens sont aux prises avec leurs pertes et l’implication que cela a sur le monde. De nombreuses théories surgissent et les gens tentent de donner un sens aux événements. L’une de ces théories est que Christ est revenu et a enlevé son église. Un groupe central d’adeptes de l’église du village de New Hope croit que la fin des jours est là, comme indiqué dans le livre de l’Apocalypse dans la Bible. Comme la Bible le prédit, il y aura sept années d’épreuves et de tribulations pendant lesquelles l’Antéchrist prendra le pouvoir et exercera sa puissance. Beaucoup d’autres mourront avant la fin des sept années, mais pour ceux qui restent, ils seront témoins de l’Apparition Glorieuse du Christ.
Deux personnes sont directement concernées : Rayford Steele, un pilote de ligne, et Cameron « Buck » Williams, un journaliste de renommée internationale. Tous deux sont profondément touchés par les disparitions et tous deux trouvent des moyens différents de gérer les conséquences de leurs effets. Rayford Steele pilote un avion en direction de Londres lorsque l’enlèvement se produit. Son esprit se tourne immédiatement vers sa femme et son fils qui sont des gens très religieux. Dès le début, il sait que l’église a été enlevée et qu’il est laissé derrière. Avec lui, sa fille Chloé est également laissée pour compte. Alors que Rayford répare ses errements, il prie également pour le salut de Chloé dans une tentative désespérée de sauver son âme.
En tant que journaliste chevronné, Buck Williams garde un œil objectif sur l’histoire, qui a des implications mondiales. En même temps que les disparitions, un jeune homme fait une ascension fulgurante dans le domaine politique. Nicolae Carpathia semble être la réponse aux prières de chacun. Individu énigmatique et puissant, il se présente comme effacé et humble. Cependant, alors que l’enquête de Buck s’ensuit et qu’il rencontre Bruce Barnes et le reste de la Tribulation Force, il se rend vite compte qu’il se retrouve face à face avec l’Antéchrist.
Au fur et à mesure que chaque personnage accepte sa nouvelle réalité, il trouve la force du nombre et de la prière pour persévérer et se préparer au combat. Ceux qui prient pour une seconde chance – et la reçoivent – exhortent constamment les autres à se joindre à eux et à être sauvés. Bien que tous les personnages ne trouvent pas Dieu et ne soient «nés de nouveau», ceux qui le font s’arment de leur nouvelle foi et soutiennent leur cause; pour passer le mot et faire ce dont ils ont besoin pour provoquer la chute de l’Antéchrist.