Toru Okada quitte son emploi de gofer dans un cabinet d’avocats à Tokyo et reste à la maison pour s’occuper de la maison pendant que sa femme travaille. Toru et Kumiko sont mariés depuis six ans. Les Okadas ont un mariage insulaire et sans enfant. Ils vivent à Tokyo avec leur chat, Noboru Wataya. La vie tranquille de Toru change quelques jours après la disparition de leur chat et il rencontre un casting inhabituel de personnages qui l’aident à explorer les liens entre l’éveil et le rêve, le passé et le présent, le bien et le mal. Une fois que la recherche du félin capricieux commence, Toru se lie d’amitié avec l’adolescente May Kasahara. Peu de temps après avoir rencontré May, Toru rencontre Malta Kano, un médium inhabituel dont la marque de fabrique est un chapeau en vinyle rouge. Malte porte le nom de l’île, tout comme sa sœur cadette Creta Kano. Ensuite, Toru fait la connaissance du lieutenant Mamiya, un ancien soldat de l’armée japonaise pendant la Seconde Guerre mondiale. Mamiya et Toru sont réunis par l’association de Mamiya avec M. Honda, qui est hanté par les souvenirs de la défaite japonaise à Nomonhan. Mamiya et Toru ont tous deux une affinité pour être au fond de puits profonds. Plus important encore, l’amitié de Toru avec le lieutenant est essentielle pour éveiller l’intérêt de Toru pour l’histoire japonaise de la Seconde Guerre mondiale.
Après que Kumiko l’ait quitté, Toru commence à regarder les gens à la gare de Shinjuku où il rencontre pour la première fois Nutmeg Akasaka. Elle et son fils, Cinnamon, sont impliqués dans une entreprise secrète et finalement Toru fait partie de leur organisation. Aller au fond du puits sur une propriété jinxed devient finalement l’objectif principal de Toru. Dans le puits, il est capable de se connecter avec sa propre conscience. De plus, il rêve régulièrement d’une chambre d’hôtel. Toru découvre bientôt qu’il est capable de traverser le mur entre le puits et la chambre d’hôtel. Après avoir traversé le mur pour la première fois, Toru découvre une marque d’encre bleu-noir, de la taille d’une petite main d’enfant, sur sa joue droite. Il y a deux événements particulièrement violents dans le roman qui influencent la vision du monde du protagoniste principal. Le premier implique Toru suivant un homme portant un étui à guitare. La deuxième scène violente a lieu lorsque Toru traverse le mur dans la salle 208. Curieusement, cet acte violent particulier apporte également une certaine résolution au subconscient de Toru. Toru Okada voyage à travers différentes incarnations de lui-même au cours du roman. Une fois, c’est un jeune garçon qui rêve. Dans un autre cas, Toru est confondu avec le père de Nutmeg, un vétérinaire du zoo de Hsin-ching portant la même marque faciale que Toru. Ces incarnations fonctionnent avec le grain de l’histoire et renforcent la position que la personnalité de Toru se fracture en quelque sorte au cours du récit, pour être réintégrée à la fin.