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Au début du livre, une race de lézard jusqu’alors sans papiers attaque des enfants au Costa Rica. Lorsqu’une Américaine nommée Tina Bowman est attaquée, elle dessine un croquis du lézard. Le croquis conduit le Dr Marty Guitierrez à trouver la carcasse d’un lézard qu’il ne peut pas identifier et l’envoie à des experts à New York pour analyse. Une technicienne nommée Alice Levin pense que la carcasse est celle d’un dinosaure et faxe une radiographie du lézard au célèbre paléontologue Alan Grant pour qu’elle soit analysée.
Alan Grant, avec son étudiante diplômée Ellie Sattler, est occupé à creuser des sites de nidification de dinosaures à Snakewater, dans le Montana, lorsqu’ils reçoivent le fax. Ils sont intrigués par la radiographie, qui ressemble précisément au corps d’un dinosaure nommé procompsognathidé. Un homme de l’Environmental Protection Agency rend visite à Alan Grant et lui pose beaucoup de questions sur son plus grand bienfaiteur, John Hammond. L’agent de l’EPA pense que John Hammond prépare quelque chose et parle à Alan Grant d’une île mystérieuse que John Hammond a achetée, ainsi que de stocks d’ambre. Après le départ de l’agent, Alan reçoit un appel de John Hammond l’invitant à visiter son île le lendemain. Alan refuse d’abord, mais John le persuade de venir, avec Ellie Sattler.
Avec Alan et Ellie, John Hammond prend le mathématicien Ian Malcolm et l’ingénieur en systèmes informatiques Dennis Nedry avant de se rendre à Isla Nublar au Costa Rica. L’avocat de John Hammond, Don Gennaro, est déjà à bord de l’avion et a demandé aux experts de venir sur l’île pour juger de sa sécurité. Personne à bord, à part John Hammond, n’a vu physiquement Isla Nublar.
Lorsque le groupe arrive sur l’île, ils découvrent que John Hammond a financé des dinosaures génétiquement fabriqués en utilisant l’ADN de moustiques fossilisés dans l’ambre. Les invités sont à la fois émerveillés et effrayés par les animaux. Les deux petits-enfants de John Hammond se présentent en hélicoptère et une visite des lieux est prévue. Personne ne sait que l’ingénieur en informatique, Dennis Nedry, a conclu un accord avec la société de bio-ingénierie concurrente Biosyn pour voler des embryons de dinosaures. Afin de commettre le crime, Dennis prévoit de fermer tous les systèmes de sécurité et d’alimentation du parc, y compris les clôtures électrifiées éloignant les dinosaures les uns des autres et des humains.
Lorsque le groupe de touristes visite le parc, Dennis coupe les systèmes d’alimentation et de sécurité. Son intention est de se rendre au lieu de rendez-vous, de déposer les embryons et de revenir dans six minutes. Dennis se perd cependant et est tué par un dilophosaurus venimeux avant d’atteindre le quai. Le parc est plongé dans l’obscurité et personne dans la salle de contrôle n’est en mesure de rétablir le courant ou de faire fonctionner les lignes téléphoniques. Un T-Rex attaque les véhicules d’excursion, tuant le publiciste du parc et blessant Ian Malcolm. Alan Grant et les enfants survivent à l’attaque et s’unissent pour tenter de retourner au lodge en toute sécurité. Ellie Sattler, Don Gennaro et le vétérinaire du parc ne sont pas conscients du chaos dans le parc alors qu’ils conduisent dans leur Jeep vers le lodge, revenant de s’occuper d’un stégosaure malade.
Alors que les gens dans la salle de contrôle tentent de rétablir le courant et de tranquilliser les dangereux dinosaures, Alan et les enfants essaient de retourner au lodge. La conclusion d’Alan selon laquelle les animaux, qui étaient auparavant censés être tous des femelles, s’accouplent est prouvée alors qu’il s’aventure dans la jungle. Le trio est confronté à plusieurs reprises à un T-Rex et s’en sort à peine vivant de chaque rencontre. Finalement, ils trouvent une voiturette de golf et sortent d’un tunnel en direction du lodge, où ils découvrent qu’ils ne sont pas beaucoup plus en sécurité. Les vélociraptors commencent à traquer le bâtiment et tous les humains à l’intérieur doivent travailler ensemble pour rester en vie. Tim Murphy, l’aîné des enfants, est en mesure de rétablir les lignes électriques et téléphoniques suffisamment à l’avance pour appeler à l’aide. Cependant, plusieurs personnages meurent à cause des dinosaures en maraude, dont le créateur du parc, John Hammond.
Avant l’arrivée des secours, Alan, Ellie et Don décident de trouver le nid de vélociraptor et de voir si tous les animaux sont présents sur l’île. Avant de pouvoir obtenir un décompte final, les rapaces se précipitent hors de la zone de nidification vers la plage et semblent ravis de voir passer un cargo. Alan décide que les rapaces ont envie de migrer et se demande s’ils l’ont déjà fait. Les autorités costaricaines arrivent pour récupérer les survivants avant qu’Alan ne puisse terminer son étude des rapaces et l’île est détruite par les bombardements.
Dans les semaines qui suivent, Alan est séquestré à San Jose, avec les autres habitants de l’île, et interrogé sur ce qui s’est passé sur Isla Nublar. Le Dr Guitierrez vient rendre visite à Alan et lui pose des questions sur un étrange mode de consommation des cultures qui se développe dans une chaîne montagneuse du pays. Alan confirme que cela ressemble à un maniérisme migratoire et le livre se termine par l’implication que les rapaces ont déjà infiltré le continent.
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