Alors que la République continue de faire la guerre aux colonies, June Iparis et Day Altan Wing montent dans un train de marchandises jusqu’à Las Vegas après avoir échappé à la tentative d’exécution de Day. Avec une jambe grièvement blessée, Day tente de rester debout dans les rues tandis que June surveille les Patriotes déguisés en soldats de la République et l’annonce de la mort du défunt électeur Primo est diffusée au-dessus. Lorsque le jour tombe, le couple échappe de peu à l’arrestation avec l’aide de Kaede. Elle les conduit à un appartement militaire de la République où ils retrouvent Tess et rencontrent le chef des Patriotes, Razor, officiellement le commandant de la République Andrew DeSoto. Ils implorent son aide pour retrouver le frère de Day, Eden, et prêtent allégeance aux Patriotes, qui envisagent de tuer le nouvel électeur, Anden.
June aide Day à se baigner et les deux s’embrassent passionnément. Day lui dit qu’il l’aime, mais elle ne répond pas. June se bat pour gagner la confiance des Patriots tandis que Day subit une opération chirurgicale avancée pour remplacer sa jambe blessée. Razor met en œuvre un plan élaboré dans lequel June conduira Anden dans un piège tandis que Day se révèle au public et provoque une révolution. Déguisé en soldat, Day monte à bord d’un navire à destination du Colorado avec Kaede tandis que June est intentionnellement arrêtée par Thomas. Inquiet, Day laisse June derrière lui tandis que Thomas l’emmène dans un pénitencier de Las Vegas.
Day atterrit à Lamar, Colorado et Kaede conduit Day à la base Patriot, reconvertie à partir d’une série de tunnels sous la ville. Il rencontre un groupe d’autres Patriots dont Baxter et Pascao, deux autres Runners. Il regarde June sur les images de sécurité et renoue avec Tess. Pendant ce temps, June convainc Thomas de l’emmener à Denver, où elle rencontre Anden. Les deux dînent dans une salle à manger élaborée et elle l’avertit d’un faux plan d’assassinat. Il demande sa confiance et lui dit qu’il veut changer la République pour le mieux. Elle passe un test de détection de mensonge et, malgré ses mensonges sur le véritable plan d’assassinat, elle réussit. Elle lutte pour rester fidèle aux Patriotes et remet en question ses propres intentions. Anden lui dit qu’il va libérer Eden et éliminer les Essais, et elle fait signe à Day d’arrêter le plan d’assassinat.
Day a du mal à réformer sa relation avec une Tess jalouse, qui, parmi les autres Patriots, se méfie de June. Il voit le signal de June sur les images de sécurité et se demande ce que cela signifie alors que lui et les autres Runners quittent la base pour bombarder un wagon et voler des fournitures. Le raid se déroule comme prévu jusqu’à ce que Day trouve un wagon marqué d’un « X », désignant des expériences sur la peste et probablement une relation avec Eden. À l’intérieur de la voiture, Day trouve un jeune garçon dans une cage de verre qui rapporte qu’il est utilisé comme arme biologique sur le front de guerre. Les civils et les soldats reconnaissent Day et des rumeurs selon lesquelles il est vivant se répandent dans toute la République. Convaincu que l’attentat à la bombe était une tentative d’assassinat, Anden déroute sa tournée de conférences prévue de Lamar à Pierra, Colorado.
June commence à se sentir malade avant d’arriver au palais de justice où l’électeur lui pardonnera pour avoir aidé Day à échapper à l’exécution. Elle demande à l’électeur de suivre ses instructions sans poser de questions, puis fait semblant de s’évanouir dans la salle d’audience. Anden ordonne à ses gardes de les emmener tous les deux à l’hôpital, mais Razor, agissant en tant que commandant DeSoto, leur ordonne de continuer vers Pierra comme prévu. Les Patriots agissent, mais Day s’écarte du plan et sauve l’électeur. Lui et June courent vers la base Patriot, accompagnés de Tess, qui refuse d’entrer. Day et June ferment l’entrée du tunnel avec une explosion et elle lui parle du désir d’Anden de changer. Se sentant trahi, Day lui crie dessus et lui dit qu’on ne peut pas faire confiance à Anden. Elle tombe de plus en plus malade et Day prend soin d’elle jusqu’à ce qu’ils réalisent que quelqu’un descend dans le tunnel pour eux. Il la récupère et ils traversent le reste du tunnel.
Le couple émerge dans la ville coloniale de Tribune, et ils s’émerveillent devant les publicités omniprésentes et l’influence des entreprises. Ils sont rapidement rattrapés et emmenés à l’hôpital. Les gardes reconnaissent Day et des foules de citoyens excités des colonies se rassemblent à l’extérieur du bâtiment. Day aperçoit Kaede dans la foule avec une pancarte l’avertissant de retourner dans la République et jette des pierres à sa fenêtre jusqu’à ce qu’il sorte. Elle lui montre le côté obscur de Tribune, où les sans-abri et les pauvres sont harcelés et arrêtés par la police privatisée. Elle lui dit que Razor a été embauché par le Sénat de la République pour tuer Anden parce qu’il était trop progressiste, et Day voit la libération d’Eden dans une actualité. Ils décident de rentrer.
Pendant que Day parle avec Kaede, June parle à Metias dans un rêve. Il la guide tout au long de la tentative d’assassinat et elle se rend compte que Razor travaille pour le Sénat de la République. Elle se réveille auprès d’un groupe de soldats des Colonies, qui la reconnaissent comme le prodige de la République. Day et Kaede reviennent juste à temps pour l’aider à échapper aux gardes, et tous les trois se dirigent vers le toit pour voler un avion. En proie à des tirs, ils décollent du toit. Kaede éloigne d’abord le jet des avions des Colonies, puis des défenses de la République. Ils survolent un tunnel ferroviaire dans l’Armor et atterrissent dans les rues de Denver. La journée traverse des foules de soldats et d’émeutiers jusqu’à la tour du Capitole, où Anden se tient sur un balcon, tentant de calmer les émeutiers. Day grimpe sur le balcon attenant et s’adresse à la foule. Il demande au Sénat de libérer les Patriotes arrêtés et demande à la foule de faire confiance à Anden. La foule répond par des acclamations.
Day et June sont tous deux emmenés à l’hôpital pour être testés pour le contrôle mental des colonies. Débarrassé de l’influence des colonies, June est démobilisée et Anden lui demande de s’entraîner pour devenir le prochain Princeps du Sénat. Day retrouve Eden avant de parler à son médecin, qui lui dit qu’il a une tumeur au cerveau et qu’il va bientôt mourir. Deux jours plus tard, il arrive à l’appartement où réside désormais June, payé par la République. Il lui donne un pendentif rubis et lui dit d’accepter l’offre d’Anden. Consciente des implications de ses paroles, elle demande s’ils peuvent trouver un moyen d’être ensemble. Il lui dit qu’il s’est passé trop de choses, mais ne lui dit pas qu’il est malade. Il se retourne pour partir mais elle l’appelle. Il se retourne et l’embrasse, puis sort.