« Poison » est le nom d’une jeune fille de seize ans vivant dans un petit village des Marais Noirs. Lorsque sa petite sœur Azalea est volée par les phaeries, elle part à sa recherche dans le monde. Aidée par un chasseur de spectres appelé Bram, elle trouve le lieu de passage vers le royaume de Phaerie. Elle affronte la terrifiante Bone Witch et aide une fille appelée Peppercorn à s’échapper de la maison. Tous les trois, guidés par le chat phaerie de Peppercorn, s’aventurent dans le royaume de Phaerie. Ils sont envoyés pour voler le couteau de la Dame des Araignées en échange d’Azalée, mais le Seigneur Phaerie revient sur sa parole à leur retour. Ils s’échappent vers le royaume du Hiérophante, où Poison apprend qu’ils sont tous des personnages fictifs d’une histoire écrite par le Hiérophante. Lorsque le Hiérophante est assassiné, Poison découvre le plan du Seigneur Phaerie pour acquérir le pouvoir du Hiérophante. Poison déjoue ce plan et est choisie comme nouvelle Hiérophante elle-même. Elle décide de créer un héros pour libérer le Royaume des Hommes des phéries.
Lorsque Azalea, la sœur de Poison, est volée par des Phaeries la veille de Soulswatch et qu’un changeling est laissé à sa place, Poison décide qu’elle ira au Royaume des Phaerie pour récupérer Azalea. Un vieil homme appelé Fleet lui donne des conseils, de l’argent et des fournitures. Poison sort des marais en stop avec un attrape-spectre appelé Bram.
Bram emmène Poison à Shieldtown. Ici, il l’aide à localiser un homme appelé Lamproie, qui lui fait jouer sa vie sur une énigme. Elle répond correctement et il lui dit qu’il y a un lieu de passage vers le Royaume de Phaerie dans la maison de la Sorcière des Os.
Bram emmène Poison chez la Bone Witch. Elle explore, mais la nuit arrive plus vite que prévu et la Bone Witch émerge. Poison est obligé de la fuir et suit un étrange chat dans les escaliers jusqu’à la chambre d’une fille appelée Peppercorn. Peppercorn a vécu ici aussi loin qu’elle se souvienne, s’occupant de la maison en échange de ne pas être mangée. Elle aide Poison à se cacher, mais lorsque la Sorcière des Os est redescendue, elle dit à Poison qu’elle ne peut pas rester ici. Poison va à la cave pour se cacher, mais la Sorcière des Os la trouve et la met dans une cage dans la cuisine.
À la surprise de Poison, Bram apparaît et la libère de la cage. Il dit que le chat est sorti de la maison pour le chercher. Poison élabore un plan et, avec l’aide de Bram, ils versent les ingrédients de la sorcière dans le chaudron, puis retirent certains des os empoisonnés du mélange. Les chiens de la Bone Witch les mangent et meurent. Ils écorchent ensuite les chiens et trompent la sorcière des os pour qu’elle les suive. Elle bascule du balcon, tombe dans son propre chaudron et meurt.
Poison, Bram, Peppercorn et le chat Andersen quittent la maison pour se rendre dans le royaume de Phaerie. Ils arrivent au palais du Seigneur Phaerie, mais le Seigneur Aelthar ne laissera partir Azalea que si Poison lui vole un poignard à la Dame des Araignées. Ils se rendent tous au royaume des araignées, où Poison parvient à déjouer une araignée géante et grimpe dans le palais. Elle vole le poignard et s’en va.
De retour au palais du Seigneur Phaerie, le secrétaire d’Aelthar, Scriddle, prend le poignard et les enferme dans une pièce. Avec l’aide d’Andersen, ils s’échappent, puis se faufilent dans les chambres d’Aelthar. Aelthar est en colère contre quelque chose que fait le Hiérophante et envisage de lui rendre visite. Poison décide que si ce Hiérophante est l’ennemi d’Aelthar, alors peut-être qu’il les aidera. Ils suivent Aelthar dans le royaume du Hiérophante.
Ici, ils voient Fleet, qui explique qu’il est un antiquaire, l’un des ouvriers du Hiérophante qui enregistre des histoires. Il montre à Poison la Grande Bibliothèque où sont conservées toutes les histoires. Il l’emmène ensuite voir le Hiérophante, qui lui dit qu’elle n’est qu’un personnage fictif dans l’histoire qu’il est en train d’écrire. Au début, Poison ne peut pas y faire face, mais Bram la persuade de ne pas abandonner.
Elle retourne voir le Hiérophante mais celui-ci a été assassiné, poignardé avec le poignard de la Dame aux Araignées. Poison accuse Aelthar, et Aelthar est ensuite assassiné par la Dame des Araignées. Poison découvre que c’est en fait Scriddle qui a planifié le meurtre. Scriddle la tue presque, mais sa complice Lady Pariasa l’arrête et guérit Poison avec sa magie. En effet, Poison a déjà été choisie comme nouveau Hiérophante, ce qui signifie que le monde se dissoudra si elle meurt.
Poison prend la position de Hiérophante. Elle découvre que sa sœur Azalea a été renvoyée dans le royaume humain il y a longtemps, alors que le temps passe différemment dans le royaume de Phaerie. Azalea a vécu heureuse avec son père et sa belle-mère jusqu’à ses vingt ans, puis elle est partie dans le monde à la recherche de Poison. Poison en est triste mais a trouvé une sœur de remplacement en Peppercorn. Poison décide de créer un héros pour libérer le Royaume des Hommes des phéries.