L’IA de DeepMind a maintenant catalogué toutes les protéines connues de la science

Fin 2020, la division DeepMind d’Alphabet a dévoilé son nouvel algorithme de prédiction du repliement des protéines, AlphaFold, et a aidé à résoudre un dilemme scientifique qui avait bloqué les chercheurs pendant un demi-siècle. Dans l’année qui a suivi sa sortie bêta, un demi-million de scientifiques du monde entier ont accédé aux résultats du système d’IA et les ont cités dans leurs propres études plus de 4 000 fois. Jeudi, DeepMind a annoncé qu’il augmentait encore cet accès en élargissant radicalement sa base de données AlphaFold Protein Structure Database (AlphaFoldDB) accessible au public – de 1 million d’entrées à 200 millions d’entrées.

Alphabet s’est associé à l’Institut européen de bioinformatique de l’EMBL (EMBL-EBI) pour cette entreprise, qui couvre les protéines de tous les règnes de la vie – animaux, plantes, champignons, bactéries et autres. Les résultats peuvent être consultés sur les sites Web UniProt, Ensembl et OpenTargets ou téléchargés individuellement via GitHub, « pour le protéome humain et pour les protéomes de 47 autres organismes clés importants pour la recherche et la santé mondiale », selon le site Web AlphaFold.

« AlphaFold est l’avancée singulière et capitale des sciences de la vie qui démontre la puissance de l’IA », a déclaré Eric Topol, fondateur et directeur du Scripps Research Translational Institute, dans un communiqué de presse jeudi. « Déterminer la structure 3D d’une protéine prenait auparavant plusieurs mois ou années, cela prend maintenant quelques secondes. AlphaFold a déjà accéléré et permis des découvertes massives, y compris la fissuration de la structure du complexe de pores nucléaires. Et avec ce nouvel ajout de structures éclairant presque le l’univers entier des protéines, nous pouvons nous attendre à ce que davantage de mystères biologiques soient résolus chaque jour. »

AlphaFold a été mis à profit dans un certain nombre d’applications, allant de l’avancement de la recherche sur la lèpre et la maladie de Chagas à la conservation des abeilles et à la lutte contre la pollution plastique. DeepMind a également développé des IA qui peuvent surpasser les meilleurs joueurs humains, maîtriser les jeux sans même connaître les règles et même améliorer les modèles de trafic. Le co-fondateur de DeepMind, Mustafa Suleyman, a quitté l’entreprise en janvier afin de lancer une nouvelle entreprise, Inflection.AI, avec le co-fondateur de LinkedIn, Reid Hoffman, peu de temps avant que des accusations de harcèlement sexuel continu ne soient portées contre l’entreprise par un ancien employé.

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