Le paradoxe temporel d’Eoin Colfer est le sixième tome de la série Artemis Fowl. Dans ce livre, Artemis est récemment revenu des Limbes et s’habitue encore à ses nouveaux frères et sœurs jumeaux, Beckett et Miles, lorsqu’il apprend que sa mère est en train de mourir d’une maladie mystérieuse. Artemis appelle immédiatement à l’aide de ses amis fées pour découvrir que la maladie de sa mère est une maladie féerique que l’on croit avoir été éradiquée. Le seul remède est le liquide cérébral d’un lémurien spécial, aujourd’hui éteint. Artemis doit voyager dans le temps pour sauver le lémurien et l’amener à sa mère à temps pour lui sauver la vie. Le Paradoxe temporel est une nouvelle aventure passionnante pour les fans d’Artemis et les nouveaux lecteurs qui les laissera tous aux prises avec les complexités du voyage dans le temps.
Artemis est dans le bureau avec ses frères jumeaux de deux ans lorsque son père arrive et lui dit que sa mère semble mourante. Artémis se précipite immédiatement aux côtés de sa mère pour tenter de la guérir avec les quantités restantes de magie qu’il a volées aux fées. Cependant, le corps de sa mère résiste à la magie et semble empirer. Alors que le père d’Artemis et Butler envisagent d’obtenir l’aide d’Angeline, Artemis contacte le capitaine Holly Short du LEP, une fée qui pourrait avoir accès à d’autres types de magie pouvant aider sa mère.
Quand Holly arrive, elle se rend compte qu’Angeline Fowl souffre d’une maladie féerique associée à une magie polluée qui dévastait autrefois la population féerique. Le seul remède est le liquide cérébral d’un lémurien propithèque soyeux de Madagascar. Cependant, ce lémurien a disparu, grâce à un incendie à Madagascar et aux propres actions d’Artemis lorsqu’il a vendu le dernier lémurien restant à un groupe appelé les Extinctionnistes. Par conséquent, Artemis se rend compte qu’il doit voyager dans le temps pour sauver sa mère. Artemis ment à Holly, lui disant que c’est de sa faute si sa mère est malade, ce qui la pousse à accepter son plan fou.
Artemis et Holly utilisent la magie d’un ami démon, N°1, pour voyager dans le temps de huit ans. Quand ils arrivent, Artemis pense qu’il sera simple de prendre le lémurien, tout ce qu’ils ont à faire est d’attendre que Butler place le lémurien dans le bureau d’Artemis. Cependant, les événements ne se déroulent pas comme Artémis les rappelle. Pour cette raison, Artemis et Holly sont attrapés par le majordome et capturés, placés dans le coffre de la famille Fowl Bentley. Heureusement, le nain Mulch Diggums arrive et les fait sortir de leur prison. Il s’avère que Mulch a trouvé une lettre d’Artemis lui promettant une grande quantité d’or s’il venait à ce moment-là pour les sauver.
Artemis envoie Holly au zoo où son jeune moi tente à ce moment-là de voler le lémurien pendant que lui et Mulch le suivront sous terre. Artemis espère voler le lémurien sous son jeune moi, mais échoue lorsque lui et Mulch se retrouvent dans la mauvaise cage. Artemis tente alors à nouveau de voler le lémurien lorsqu’il grimpe sur un pylône électrique, mais échoue à nouveau lorsque son jeune moi menace de tirer sur le lémurien et de le laisser tomber jusqu’à la mort.
Les Artemis plus âgés et Holly suivent le plus jeune Artemis à l’échange avec le chef des Extinctionnistes, dans l’espoir de voler le lémurien pendant l’échange. Artemis et Holly réussissent à obtenir le lémurien de la jeune Artemis. Cependant, la jeune Artemis parvient à kidnapper Holly. La jeune Artemis vend alors Holly à l’Extinctionniste. Artemis, l’aînée, organise un sauvetage pour Holly, mais cela tourne mal et il se retrouve entre les mains d’Opal Koboi, un lutin qui était autrefois un membre brillant du monde des fées mais qui veut maintenant devenir impératrice du monde. Opal a besoin du lémurien pour augmenter ses pouvoirs et la rendre imparable.
Artemis, plus âgé, parvient à échapper à Opal, mais au fur et à mesure qu’il voyage dans le temps, il commence à se rendre compte qu’il y a des bizarreries concernant la maladie de sa mère. Artemis met en œuvre un plan pour prouver ses théories, réalisant que sa mère n’est pas vraiment malade, mais qu’Opal a pris le contrôle de son corps et l’utilise pour attraper le lémurien. Artemis parvient à déjouer Opal, l’amenant à le poursuivre jusqu’à une petite île près de chez lui où il la piège sous terre.