The Second Foundation est le troisième volet de la série Foundation d’Issac Asimov. Divisé en deux parties, « Recherche par la mule » et « Recherche par la Fondation », il détaille deux tentatives infructueuses pour tenter de retrouver et de détruire la Deuxième Fondation. La Deuxième Fondation contrecarre la tentative du Mulet lorsqu’ils le piégent sur la planète Rossem et conditionnent son esprit à croire que la Deuxième Fondation n’a jamais existé. Cinquante-cinq ans plus tard, la Fondation tente de les retrouver pour tenter de renoncer au contrôle qu’ils ont sur leur destin. Cependant, encore une fois, la Deuxième Fondation s’avère trop forte.
Dans la première partie, le Mulet a pratiquement détruit la Fondation et a commencé à construire son propre Empire. Cependant, il sait qu’il ne pourra jamais vraiment prétendre au succès tant qu’il n’aura pas trouvé et détruit la mythique Seconde Fondation et qu’il n’aura pas envoyé son général, Hans Pritcher, et l’indigne Bail Channis à sa recherche. Grâce à ses compétences de contrôle mental, le Mulet sait que Channis est un agent de la Deuxième Fondation, mais en même temps, il compte sur Channis pour conduire par inadvertance le Mulet au bon endroit.
Channis emmène Pritcher sur la planète Rossem. À ce stade, Pritcher se méfie de son camarade et l’arrête pour trahison. Il dit à Channis que dans quinze minutes, le Mulet arrivera et le tuera. Cependant, au moment où Mule arrive, Channis a repris l’esprit de Pritchard. Bien que son contrôle mental soit inférieur à celui du Mulet, il lui dit que s’il ne pose pas son blaster, il donnera à Pritchard l’ordre de le tuer. Si le Mulet pose son blaster, il pourra récupérer l’esprit de Pritchard. Le Mulet abandonne son arme et entreprend d’affaiblir la détermination de Channis. Heureusement, Channis n’a qu’à attendre quelques instants avant que le premier orateur de la Seconde Fondation n’entre dans la pièce. Le Premier Orateur dit au Mulet que Channis l’a emmené sur la mauvaise planète. Channis pense que Rossem est la Deuxième Fondation, mais uniquement parce que la Deuxième Fondation a conditionné son esprit. Channis a accepté le conditionnement afin de conduire le Mulet dans un piège sans risquer de révéler sa véritable position. À ce stade, le Mulet baisse sa garde et le Premier Orateur entre dans son esprit. Il conditionne le Mulet à croire que la Deuxième Fondation n’existe pas.
Dans la deuxième partie, Arcadia Darell, 14 ans, est en train de rédiger un rapport pour l’école lorsqu’un homme apparaît à sa fenêtre. Le nom de l’homme est Pelleas Anthor et dit qu’il est venu voir son père, le Dr Darell. À ce stade, le Dr Darell entre dans la chambre de sa fille. Il attendait Anthor et l’emmène en bas pour parler.
Sept jours plus tard, le Dr Darell, Anthor, Homir Munn, le Dr Elvett Semic et Jole Turbor se rencontrent pour discuter de la Deuxième Fondation. Ils décident d’envoyer Homir Munn à Kalgan où il pourra visiter le palais désormais vide du Mulet et trouver des informations. A l’étage, Arcadia écoute leur conversation.
Le lendemain, Munn part pour Kalgan. Cependant, à mi-chemin du voyage, il trouve Arcadia cachée dans sa soute à bagages. Réalisant que faire demi-tour lui semblerait suspect, il décide qu’il n’a d’autre choix que d’emmener Arcadia avec lui.
Lorsqu’ils arrivent à Kalgan, Munn parvient à organiser une réunion avec le chef de Kalgan, Lord Stettin. Stettin autorise Munn à accéder aux dossiers du Mulet mais se méfie bientôt de ses véritables motivations. Lors de leur deuxième rencontre, Stettin dit à Munn qu’il connaît la véritable raison pour laquelle il est venu à Kalgan et qu’il a décidé de le retenir, lui et Arcadia, prisonniers, pendant qu’il mène une guerre contre la Fondation. Dans la pièce voisine, la maîtresse de Stettin, Callia, aide Arcadia à s’échapper.
Arcadia s’enfuit vers le port spatial de Kalgan. Elle sait qu’elle ne peut pas retourner à la Fondation alors elle achète un billet pour Trantor. Juste avant qu’elle s’apprête à partir, la police de Kalgan entre dans le terminal pour l’arrêter. Désormais dans une situation désespérée, elle rencontre le commerçant Palver Preemer et sa femme. Preemer soudoie la police et ramène Arcadia chez lui à Trantor.
À Trantor, Arcadia a des informations qu’elle doit transmettre à son père, mais avec une guerre qui fait actuellement rage, il lui est impossible de partir. Elle décide que son meilleur pari est de persuader Palver que la guerre est potentiellement très rentable pour un commerçant et qu’il pourrait vendre ses marchandises à la Fondation. Palver reconnaît que c’est une excellente idée et part avec l’intention de faire fortune et la promesse qu’il transmettra son message au père d’Arcadia.
La Fondation bat Kalgan et les cinq conspirateurs se retrouvent à nouveau chez le Dr Darell. Homir Munn dit à ses amis qu’il n’a trouvé aucune preuve de l’emplacement de la Deuxième Fondation et pense qu’elle n’existe pas. Cependant, Anthor réfute cette affirmation et affirme que les membres de la Deuxième Fondation ont altéré l’esprit de Munn. Il dit que la Deuxième Fondation est située sur Kalgan. Le Dr Darell n’est pas d’accord. Il dit qu’il est resté sur Terminus pour développer un dispositif Mental Static. Cet appareil peut détecter les membres de la Deuxième Fondation en bloquant leurs ondes cérébrales, et l’appareil n’a trouvé aucune preuve que Kalgon abritait des membres de la Deuxième Fondation. En fait, Arcadia lui a envoyé un message disant qu’un cercle n’a pas de fin, et c’est à partir de ce message qu’il a réalisé que la Deuxième Fondation se trouvait sur Terminus. Anthor dit que ce n’est pas vrai, mais Darell allume le dispositif statique mental, prouvant qu’Anthor est un Second Fondateur.