Children of the Mind est le quatrième et dernier roman du quatuor Ender, continuant précisément là où Xenocide s’arrête. En fait, le roman commence même au moment où Si-Wang-mu, la jeune servante de Path, rejoint l’idée originale d’Ender, Peter, pour le rejoindre dans sa mission d’empêcher la flotte Lusitania de détruire Lusitania. Pendant ce temps, le beau-fils d’Ender, Miro et Young Valentine, l’autre enfant de l’esprit d’Ender, continuent de rechercher de nouvelles planètes habitables. Jane, l’être incroyable qui habite dans les réseaux informatiques et de communication longue distance, déplace rapidement les colons hors de la planète en utilisant sa capacité nouvellement acquise à affecter le voyage interstellaire instantané avant sa propre destruction imminente à cause du Congrès de Starways qui a ordonné sa fermeture.
Avec une catastrophe imminente, Jane et ses alliés pourraient grandement utiliser l’aide d’Ender, mais Ender, fatigué par plus de 3000 ans à diriger activement le destin de la race humaine, se retire dans l’ordre monastique « Les Enfants de l’Esprit » afin de se réconcilier avec son ex-femme, Novinha. Miro supplie son aide, mais Ender refuse, se sentant dégagé de toute responsabilité car il a créé Peter et Val, deux versions alternatives de lui-même, pour continuer son travail. Il offre même le corps de Young Val à Jane, disant à Miro qu’elle y est la bienvenue si elle peut trouver un moyen de l’habiter avant qu’elle ne soit fermée. Pourtant, le maintien de trois corps séparés est une contrainte pour Ender. Non seulement Young Val se désintègre, mais Ender lui-même s’effondre, près de la mort, avec l’effort de garder trois corps en vie. À la demande de Miro, la reine de la ruche commence à travailler avec ses sœurs et les arbres-pères pequenino pour découvrir un moyen de sauver Jane en l’aidant à emménager dans le corps de Young Val.
Peter et Si Wang-mu commencent leur voyage sur la planète du Vent divin. C’est un monde fondé par des colons japonais, afin de rencontrer Aimaina Hikari, la philosophe japonaise qui est à la tête intellectuelle et spirituelle de l’école Necessarian. Hikari était responsable de l’oscillation du vote du Congrès Starways pour envoyer la flotte Lusitania. Leur visite l’afflige beaucoup. Il se tourne vers un ami sur le monde Pacifica pour obtenir des conseils, incitant Peter et Wang-mu à lui rendre visite afin de tenter d’influencer l’ami d’Hikari. Sur le monde samoan de Pacifica, Peter et Wang-mu consultent le saint homme Malu qui les informe que Jane peut en effet être sauvée et que Jane peut habiter « un mais pas les deux » du corps de Peter ou de Young Val.
La fermeture du réseau commence et Jane commence à perdre ses capacités, ses souvenirs et même son estime de soi. Human et la reine de la ruche, utilisant la plus grande toile philotique jamais tissée, parviennent à attraper l’aiua (force vitale) de Jane et la guident vers celle d’Ender. L’aiua d’Ender tente de conduire Jane dans les différents corps qu’elle habite, mais le transfert de Jane sous forme humaine échoue. Au niveau le plus profond de son être, Ender est incapable de rendre aucun des corps et même si l’aiua de Jane est assez puissant pour prendre un corps par la force, il se rend compte qu’il ne peut pas exister dans un corps qui serait en perpétuelle rébellion. L’aiua de Jane continue d’explorer et vient temporairement habiter les connexions philotiques entre les arbres-mères, ce qui l’empêche de mourir.
Après s’être précipités à temps pour monter ce qui pourrait être une mission finale et fatale sur la planète natale des descoladores avant la fermeture de Jane, Miro et Young Val sont rejoints par Ela, Quara, le pequenino Firequencher et un travailleur de la ruche. Cela leur permet de rester en contact avec la reine de la ruche et donc Lusitania. La jeune Val se rend compte qu’elle ne pourra pas abandonner son corps à Jane à moins qu’elle ne soit convaincue qu’elle doit mourir. Elle entraîne Miro dans un terrible combat au cours duquel il la convainc que tout le monde à bord du navire veut qu’elle meure pour qu’ils puissent vivre. Pendant ce temps, à la demande de Val, Novinha dit à Ender qu’elle veut qu’il vive comme Peter et le libère de toutes les obligations qu’il a envers elle. Cette fois, les aiuas bougent à nouveau, définitivement. La douceur de Val et l’aiua d’Ender se déplacent dans Peter faisant un être complet. L’aiua de Jane prend le contrôle de Young Val. Cependant, Jane ne retrouve pas immédiatement ses anciennes capacités, et le vaisseau spatial de Miro continue d’orbiter autour de la planète descoladore sans aucun espoir certain de retourner en Lusitania.
Sur Pacific Wind, Peter et Wang-mu sont emmenés dans une université pour voir le nouveau système informatique « à l’épreuve de Dieu » mis en ligne. Les alliés et fidèles de Jane ont réussi à mettre en réseau des milliers d’ordinateurs et à les relier illégalement aux ansibles du Congrès Starways. Bien que le matériel ne représente qu’une fraction de la capacité antérieure de Jane, elle est capable de récupérer ses programmes et ses souvenirs les plus vitaux et de se rétablir. Le nouveau matériel, cependant, la restreint. Ce n’est que lorsqu’elle découvre comment utiliser le réseau philotique parmi les arbres-mères pour le stockage qu’elle regagne une capacité suffisante pour recommencer à voyager plus vite que la lumière. Au moment où Jane retrouve ses anciennes capacités, l’alerte arrive : la flotte Lusitania est entrée à portée et a déployé le Little Doctor. Avec pas plus d’une heure, Jane commence à déplacer tous les colons qu’elle peut hors de la planète.
Jane demande l’aide de Peter, et lui et Wang-mu emmènent le Petit Docteur à bord d’une navette utilisant pleinement les capacités de Jane. Peter et Wang-mu ramènent l’appareil maléfique dans la soute du même navire qui a lancé l’arme. L’amiral en charge de la flotte a peu de succès à arrêter Peter et Wang-mu étant donné la facilité avec laquelle Jane est capable de les téléporter d’un endroit à l’autre. Peu de temps après, le premier officier de l’amiral désactive le petit docteur et Peter désarme l’amiral, se cassant accidentellement deux de ses doigts. À contrecœur, l’amiral est convaincu de déposer un rapport auprès du Congrès Starways qui explique comment la menace de la descolada a été neutralisée et que la rébellion de Lusitania n’était en réalité qu’un malentendu.
Maintenant que Lusitania est redevenue sûre pour les colons, beaucoup reviennent des nouveaux mondes. Les amis et la famille d’Ender se réunissent pour le faire reposer. Son élève, Plikt, parle de sa mort. Le même jour où il est inhumé, Peter épouse Wang-mu et Jane épouse Miro lors d’une double cérémonie privée. Le roman se termine avec Jane se transportant elle-même et les autres jeunes mariés dans un endroit inconnu.