Dans le jeu, après qu’une pandémie mondiale a décimé le monde, transformant un grand nombre de personnes en Freakers ressemblant à des zombies qui mangent les gens, la société est devenue un désastre. L’histoire de « Days Gone » suit un motard nommé Deacon St. John dans le nord-ouest du Pacifique alors qu’il tente de survivre à ce que le monde est devenu.
L’épouse de Deacon, Sarah Whitaker (exprimée dans le jeu par Courtnee Draper) et son ami William « Boozer » Gray (exprimé par Jim Pirri) tentent de trouver la sécurité, ce qui conduit Sarah à être transportée par avion vers un camp de réfugiés. Deacon apprend que le camp a été envahi par les créatures malades et que Sarah est présumée morte. Des informations arrivent plus tard qui font croire à Deacon qu’elle pourrait être en vie, et il entreprend de la retrouver.
Deadline rapporte que le scénario est « une ballade d’amour aux films de motos » et qualifie l’histoire de « western des temps modernes ».