Biloxi Blues est le deuxième d’une trilogie de pièces semi-autobiographiques de Neil Simon qui couvrent la vie d’un écrivain qui a grandi dans les années 1930 à New York. La « Trilogie Eugène » commence avec la pièce Brighton Beach Memoirs et se termine avec Broadway Bound. Eugene Morris Jerome est le personnage principal et dans Biloxi Blues ; nous sommes en 1943 et il vient d’être enrôlé dans l’armée américaine. La pièce couvre la période de temps qu’Eugène passe en formation de base à Biloxi, Mississippi. Biloxi Blues a ouvert ses portes à Los Angeles en 1984, puis à New York en 1985. Il a remporté le Tony Award de la meilleure pièce en 1985 – la première des deux fois où Neil Simon a reçu ce prix.
La pièce commence dans un train bondé alors que plusieurs jeunes soldats de la côte est sont envoyés au camp d’entraînement de base de l’armée américaine à Biloxi, Mississippi. Eugene Morris Jerome reste éveillé, écrivant dans ses mémoires, tandis que les autres soldats autour de lui essaient de dormir. Au fur et à mesure que chaque personnage est présenté, Eugène lit son commentaire écrit sur le jeune homme au public. Il y a Roy Selridge, un gars malodorant de Schenectady, New York qui a « des caries dans dix-neuf dents sur trente-deux ». Ensuite, Joseph Wykowski de Bridgeport, Connecticut, qui mange n’importe quoi et a une «érection permanente», puis Donald Carney de Montclair, New Jersey, qui insiste pour chanter malgré sa voix horrible. Arnold Epstein, de Queens Boulevard, New York, est intellectuel et cultivé mais souffre d’une mauvaise digestion. Eugene explique qu’il n’a jamais été loin de chez lui auparavant, mais qu’il a trois objectifs pour son temps dans la guerre : rester en vie, devenir écrivain et perdre sa virginité.
Après leur arrivée à Biloxi, les jeunes hommes rencontrent leur commandant, le sergent Toomey. Toomey est un soldat qui parle dur avec une plaque d’acier dans la tête qui essaie de briser les hommes en appliquant des règles injustes et en ordonnant des toilettes comme punition pour manque de respect. Arnold Epstein entame une bataille de volontés avec Toomey qui dure tout au long de l’entraînement de base et gagne de nombreuses pompes à Epstein, bien qu’il soit prêt à les faire, car il pense qu’il défend sa dignité. Les autres hommes essaient juste de rester à l’écart de Toomey et font le minimum pour survivre à l’entraînement.
Eugene est capable d’atteindre l’un des objectifs de sa liste lorsqu’il perd sa virginité au profit d’une prostituée. Peu de temps après, il rencontre Daisy Hannigan : une belle fille catholique cultivée qui fréquente une école pour filles à Gulfport. Les deux commencent à écrire des lettres et à se voir autant que possible. Eugene avoue son amour pour Daisy juste avant son déploiement et elle lui dit qu’elle l’aime aussi. Même si les chances qu’Eugene et Daisy finissent ensemble après la guerre sont minces, Eugene dit que sa relation avec Daisy lui a donné de quoi vivre.
Dans la scène finale de la pièce, les jeunes hommes sont de retour dans un wagon de train s’éloignant de Biloxi et suivent une formation de base. Pendant que ses camarades dorment, Eugène s’adresse au public et leur raconte ce qui arrive à chaque personnage après la guerre. Le public apprend qu’Eugene atteint ses objectifs de rester en vie et de devenir écrivain, bien que peut-être pas de la manière à laquelle il s’attendait.