Les sous-variantes BA.4 et BA.5 du coronavirus Omicron représentent désormais environ 35% des cas aux États-Unis, selon les Centers for Disease Control and Prevention. Les sous-variantes sont sur la bonne voie pour atteindre la domination à un rythme plus rapide que les sous-variantes qui les précèdent, y compris la sous-variante actuelle, BA.2.12.1, qui est maintenant en déclin.
La paire – qui partage les mêmes mutations dans leurs protéines de pointe SARS-CoV-2 mais qui ont des différences ailleurs dans leurs génomes – devrait atteindre la domination « dans quelques semaines », a déclaré le Dr Shishi Luo à Ars. Luo est le responsable des maladies infectieuses chez Helix, une société californienne de génomique des populations et de surveillance virale qui travaille avec le CDC pour aider à suivre les variantes émergentes de coronavirus à l’échelle nationale.
On ne sait pas exactement ce qui nous attend dans cette dernière phase de la pandémie. Ce que nous savons des deux sous-variantes jusqu’à présent est mitigé.
Mauvaise et bonne nouvelle
Lorsque BA.4 et BA.5 ont été détectés pour la première fois en Afrique du Sud en avril, il est rapidement devenu clair que les deux peuvent échapper aux réponses immunitaires de la vaccination et de l’infection passée, même l’infection par les variantes précédentes de l’omicron.
Mercredi, des chercheurs de Boston ont publié des données dans le New England Journal of Medicine qui ont renforcé ces conclusions. Les dernières données ont révélé que les personnes qui avaient été vaccinées et renforcées avaient des titres d’anticorps neutralisants 21 fois plus faibles contre BA.4 et BA.5 par rapport aux niveaux contre la version originale du SARS-CoV-2. Et ces niveaux d’anticorps neutralisants étaient également 3,3 fois plus faibles que les niveaux contre BA.1. De même, chez les personnes qui avaient déjà été infectées par BA.1 ou BA.2 (dont la plupart avaient également été vaccinées), les niveaux d’anticorps neutralisants contre BA.4 et BA.5 étaient encore près de 3 fois inférieurs aux niveaux contre BA. .1.
De plus, une étude préimprimée publiée récemment a révélé que BA.4 et BA.5 semblaient causer une maladie plus grave chez les hamsters que BA.2 et BA.2.12.1.
Mais, il y a de bonnes nouvelles jusqu’à présent : les données d’hospitalisation d’autres pays où BA.4 et BA.5 ont déjà augmenté, y compris l’Afrique du Sud, suggèrent que les variantes ne causent pas de maladies plus graves et d’hospitalisations chez l’homme.
Ainsi, avec des antiviraux qui sont toujours efficaces et la vaccination qui protège toujours contre les maladies graves et la mort, Luo dit qu’il n’est pas temps de s’inquiéter vraiment. « Je ne pense pas que ce soit nécessaire », a déclaré Luo à propos de la vague à venir.
Qu’est-ce qui nous attend
Mais, alors que BA.4 et BA.5 approchent de la domination aux États-Unis – ce qui en fait les quatrième et cinquième sous-variantes d’omicron à dominer les cas cette année seulement après BA.1, BA.2 et BA.2.12.1 – la question se pose : Et après?
Avec BA.4 et BA.5 apparus en Afrique du Sud il y a quelques semaines, nous avons eu l’occasion de voir cette prochaine vague arriver. Mais « pour le moment, il ne semble pas y avoir d’autres variantes en hausse », a déclaré Luo. Il y a toujours des échantillons de virus ici et là qui n’ont pas encore de lignée attribuée – il peut s’agir de nouvelles variantes – mais aucun ne semble s’accélérer, infectant un nombre croissant de personnes, a-t-elle déclaré. Cela signifie que BA.4 et BA.5 pourraient jouir d’un règne plus long que leurs prédécesseurs en l’absence d’usurpateurs prometteurs.
« Mais vous savez, cela pourrait changer dans les prochains jours », a déclaré Luo. « Je ne laisserais pas passer ce virus pour muter encore une fois et qu’il y ait encore une autre vague. »
Les régulateurs fédéraux et les fabricants de vaccins se préparent à ce que les sous-variantes d’omicron soient avec nous au moins jusqu’à l’automne et l’hiver. La Food and Drug Administration se prépare à autoriser les vaccins et les rappels de nouvelle génération pour l’automne qui pourraient contrecarrer une poussée saisonnière. Des conseillers experts du régulateur se réuniront la semaine prochaine, le 28 juin, pour discuter de la formulation de ces vaccins de nouvelle génération. Les meilleurs candidats sont ceux qui ciblent omicron.
Plans à court et à long terme
Mercredi, Moderna a publié des données préliminaires préliminaires qu’elle présentera à la FDA, montrant que son vaccin combiné (bivalent) ciblant à la fois la version originale du SRAS-CoV-2 et la variante originale d’omicron peut renforcer la protection contre BA.4 et BA.5. Moderna dit que le rappel bivalent, surnommé ARNm-1273.214, peut augmenter jusqu’à 6 fois les niveaux d’anticorps neutralisants contre BA.4 et BA.5.
« Face à l’évolution continue du SRAS-CoV-2, nous sommes très encouragés par le fait que l’ARNm-1273.214, notre principal candidat de rappel pour la chute, ait montré des titres neutralisants élevés contre les sous-variants BA.4 et BA.5, qui représentent une émergence menace pour la santé publique mondiale », a déclaré le PDG de Moderna, Stéphane Bancel, dans un communiqué. « Nous soumettrons ces données aux régulateurs de toute urgence et nous nous préparons à fournir notre rappel bivalent de nouvelle génération à partir d’août, avant une augmentation potentielle des infections par le SRAS-CoV-2 due aux sous-variantes de l’omicron au début de l’automne. »
Alors que les perspectives à court terme de Moderna sont optimistes, Luo s’inquiète de l’évolution virale continue et de notre potentiel décroissant à détecter de nouvelles variantes. Alors que les gens essaient de sortir de la phase aiguë de la pandémie, ils soumettent moins d’échantillons pour les tests. « Pour l’avenir, nous devons déterminer, y aura-t-il [enough samples]? … Si ce n’est pas le cas, y aura-t-il suffisamment de personnes se présentant aux soins d’urgence, aux systèmes de santé ou aux hôpitaux, où il est possible de prélever un échantillon et de l’envoyer pour séquençage ? Je pense qu’un système qui fait cela à grande échelle n’existe pas encore », a déclaré Luo.
Bien que Helix cherche des moyens de mettre en place de tels systèmes de surveillance, Luo dit qu’il doit y avoir une stratégie nationale plus large pour garder une longueur d’avance sur les variantes. « Même si, pour le moment, nous ne pensons pas qu’il y ait une autre variante à l’horizon, il semble que nous ayons besoin d’un plan sur la façon dont nous allons, en tant que pays, y répondre », a-t-elle déclaré. « Nous ne pouvons pas continuer à espérer que cela disparaisse tout seul. » Dans le pire des cas où une autre variante surgit qui contrecarre les traitements et les vaccins, « nous ne voulons pas revenir à la case départ, n’est-ce pas ? Nous avons besoin d’un plan ».