Maximum Ride et son troupeau doivent empêcher le groupe Doomsday d’exterminer la race humaine. Max a le cœur brisé après avoir été abandonné par Fang, l’amour de sa vie. Elle est encore plus dévastée d’apprendre qu’il a fondé son propre troupeau et qu’il traîne avec Maya, le clone de Max. Max se ressaisit avec l’aide de Dylan, un garçon séduisant qui a été créé pour être le parfait compagnon de Max. Le troupeau de Max l’a emmenée chez sa mère afin de l’aider à sortir de sa dépression. Le troupeau reçoit la visite de Jeb et du Dr Hans, qu’ils détestent, et leur demande de rendre visite aux enfants de la génération 77. Les enfants sont une nouvelle race d’expériences.
Fang et sa bande découvrent le Doomsday Gang, un groupe de personnes qui vénèrent la Lumière Unique. Le groupe essaie d’éradiquer la race humaine. Ils veulent que tous les enfants soient génétiquement modifiés et dirigent un nouvel ordre mondial. Alors que le troupeau de Max a été créé dans des tubes à essai à partir d’un mélange d’ADN humain et aviaire, le nouveau groupe de Fang a été génétiquement modifié dans un laboratoire après la naissance. Fang a reçu l’ordre de créer un gang afin de sauver le monde.
Après que la sœur de Max soit presque améliorée par le groupe Doomsday, le troupeau et le gang unissent leurs forces pour combattre le groupe. Ils parviennent à empêcher le Groupe de tuer des dizaines de milliers de personnes à Paris, mais ils n’ont toujours pas découvert l’identité du cerveau, le One Light. Max se bat contre ses sentiments pour Fang et ses sentiments grandissants pour Dylan. Elle se sent remplacée dans la vie de Fang par Maya. Fang pense qu’il doit sacrifier leur relation pour sauver le monde.
À la fin du livre, la bande et le troupeau se séparent. On croit qu’Angel est mort, mais il est en réalité détenu dans un laboratoire.