Comment les variantes de COVID-19 émergent – et comment nous pouvons nous préparer pour la prochaine

Combien de mutations supplémentaires le SRAS-CoV-2 peut-il subir ?

C’est un vœu pieux d’imaginer que le SRAS-CoV-2 s’essouffle, que son évolution est en quelque sorte terminée, « parce que nous en avons tellement fini culturellement, politiquement et économiquement », a modélisé le COVID-19 Caroline Colijn, de l’Université Simon Fraser , a déclaré dans une interview précédente. « Je pense que l’évolution continuera d’agir. La façon d’empêcher l’évolution de nous donner plus de variantes est de réduire la taille des populations de virus, et c’est ce qu’on appelle les infections. Il ne s’agit pas seulement d’hospitalisations.

« Il n’y a pas d’organisme qui reste immobile », a déclaré Shapiro de McGill, membre du CoVaRR-Net. « Tout continue de muter et de s’adapter. Il continuera de le faire. C’est ce que fait la grippe. C’est à prévoir. Cela ne devrait pas être alarmant. La question, a déclaré Shapiro, est : y a-t-il une limite à sa transmissibilité intrinsèque, « qui est déjà vraiment, vraiment élevée. Ira-t-il encore plus haut ? C’est ce que la sélection va toujours promouvoir – chaque fois qu’il y a une variante qui peut se reproduire plus rapidement, elle sera sélectionnée, elle décollera. Il est difficile de savoir quelle sera la limite.

Que pourrait-il advenir ensuite ?

Un virus peut changer de deux manières : la « dérive » antigénique, c’est-à-dire de petits changements ou mutations subtils, comme nous le voyons avec les BA-2. L’autre changement est un changement, un changement brutal et majeur. Omicron était un changement, pas une dérive. « Omicron n’est lié à aucun des Deltas », a déclaré Shapiro. «Il s’est ramifié bien plus tôt, probablement au milieu de 2020, et avait mijoté dans une population non échantillonnée, ou un réservoir animal, ou une personne immunodéprimée, ou une combinaison de ces choses, puis a émergé et a vraiment commencé à décoller fin 2021. »

La prochaine grande variante pourrait provenir directement d’Omicron, ou être extrêmement divergente, d’une autre branche profonde, et les gens ne devraient pas accrocher leur chapeau à la gravité inférieure d’Omicron, trois chercheurs

écrire dans Nature Reviews.

Ce n’est « rien d’autre qu’une heureuse coïncidence » qu’Omicron provoque une maladie plus bénigne. Au fur et à mesure que le monde sera exposé et vacciné, la pression sera sur le SRAS-CoV-2 pour continuer à perfectionner sa capacité à se réinfecter. « Une fois qu’Omicron aura infecté la majorité des individus, la prochaine variante devra être aussi antigéniquement différente d’Omicron et des précédentes (variantes préoccupantes ou COV) que possible pour surmonter l’immunité contre eux », ont-ils écrit. « La perspective de futurs COV présentant la combinaison potentiellement désastreuse de la capacité de réinfecter en raison de l’évasion immunitaire avec une virulence élevée est malheureusement très réelle. »

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