La version suivante de ce livre a été utilisée pour créer le guide : Crowley, Cath. Words in Deep Blue. Ember, 2016.
Rachel a abandonné l’école à cause de la noyade de son frère et retourne maintenant dans la ville où elle a grandi. Elle et sa mère pleurent son frère tous les jours, mais elle décide de vivre avec sa tante à la place. Henry est assis dans la librairie familiale, Howling Books, lorsque sa petite amie Amy rompt avec lui. Il repense à la nuit où ils se sont retrouvés, une nuit que les élèves de son école prétendaient être la dernière nuit du monde. Avant cette nuit-là, il avait toujours été le meilleur ami de Rachel. Cependant, il l’a abandonnée pour Amy cette nuit-là.
Rachel a toujours eu un béguin secret pour lui et lui a laissé une lettre d’amour avant de déménager. Lorsqu’elle revient, la première chose qu’elle fait est d’aller au concert du groupe de sa vieille amie Lola. Rachel trouve également un emploi à la librairie familiale d’Henry, où elle enregistre les marginalia, les lettres et les annotations laissées par les gens dans la bibliothèque de prêt qui fait partie de la librairie.
Dans la rue avant le spectacle, elle croise Henry. Bien qu’elle ait voulu l’éviter, ils entrent ensemble dans la salle. Il boit jusqu’à l’oubli lorsqu’il voit Amy avec un garçon qu’il pense être un connard : Greg Smith. Lorsque Greg le pousse, Henry tombe et seule Rachel l’aide à se relever pendant qu’Amy regarde.
Rachel découvre qu’Henry n’a jamais reçu sa lettre d’amour alors qu’il est saoul et il l’embrasse sans s’en rendre compte. À son réveil, Henry décide qu’Amy a dû le quitter car Greg est plus riche. Ses parents envisagent depuis un certain temps de vendre la librairie sans profit et Henry décide de voter pour la vente afin de récupérer Amy.
Il y a quelques années, une personne du nom de « Pytheas » échangeait régulièrement des lettres avec la sœur cadette d’Henry, George. Leur relation a évolué au point qu’il lui a demandé de sortir avec lui de manière anonyme, ce qu’elle a accepté. Aujourd’hui, un garçon nommé Martin essaie également d’échanger des lettres avec George, mais elle est en colère à cause de ses liens avec un tyran de son école. Henry décide que lui, Rachel, Martin et George iront à une fête ensemble. Cependant, les deux couples finissent par se battre entre eux et la soirée se termine misérablement pour chacun d’eux.
Jusqu’à présent, Rachel n’a parlé à personne à Gracetown de la mort de son frère Cal. Cependant, elle s’ouvre à Henry et il répond avec gentillesse. Cela change quelque chose dans leur relation, et ils redeviennent les meilleurs amis du monde. Lorsque George trompe Martin en l’emmenant dans une zone dangereuse et qu’Henry l’accompagne, ils sont kidnappés par Greg et ses amis. Ils sont attachés à des poteaux avec du ruban adhésif, nus, et ils doivent attendre que Rachel les sauve.
Rachel, Lola et George sauvent Martin et Henry. Ensuite, Rachel et Henry ont une discussion à cœur ouvert dans la librairie. Ce week-end, Rachel et tous deux sortent danser. Rachel embrasse Henry pendant qu’Amy regarde et dit que c’est pour la rendre jalouse. Cela fonctionne, car Amy s’excuse auprès de lui peu de temps après et ils se remettent ensemble. Henry décide également de garder la librairie, mais oublie de le dire à ses parents. Entre-temps, la librairie est vendue.
Rachel avoue son amour à Henry et, au moment où Henry est sur le point de lui répondre, Amy apparaît et l’embrasse. Cela fait pleurer Rachel et s’enfuit, tandis qu’Henry réalise qu’Amy n’a pas été la bonne personne pour lui depuis le début. En pleurant, Rachel retrouve George et lui explique que Cal était Pytheas, mais qu’il est décédé. Rachel a la dernière note de Cal. Henry revient, lui avouant son amour. Ils s’embrassent.
Rachel se rend compte que ce n’est pas parce que la librairie est vendue que les livres marqués doivent être perdus. Elle convainc Henry et sa famille de l’aider à cacher les livres dans la ville, et ils maintiennent la bibliothèque en vie. Forte de cette paix, Rachel revient disperser les cendres de Cal dans la mer.