Count Zero est un roman cyberpunk qui se déroule dans un avenir gouverné par les entreprises où les informations sont partagées dans une construction de masse appelée cyberespace. Turner est un mercenaire engagé pour aider un scientifique à échapper à son contrat avec une grande entreprise et à passer à une autre entreprise. Au lieu de cela, il se retrouve avec la fille du scientifique, à qui on a implanté une biomécanique cérébrale qui lui permet de canaliser des intelligences artificielles vivant comme des dieux dans le cyberespace. Turner l’aide à s’échapper vers un groupe de praticiens vaudous qui traitent avec les dieux du cyberespace avant qu’il ne se retire de sa vie de mercenaire.
Au début du roman, Turner explose lors d’un travail à New Delhi et est reconstruit. Au Mexique, il s’implique avec un psychologue infiltré envoyé pour le vérifier pour son prochain travail de mercenaire, extrayant un scientifique d’une société pour travailler pour une autre société. Dans ce travail, les choses tournent mal. L’avion de la cible arrive, avec la sécurité de l’entreprise sur ses talons, mais la cible n’est pas le scientifique attendu par Turner. C’est la fille du scientifique, Angie Mitchell. Turner décolle dans un avion avec Angie, et derrière eux le site d’extraction explose dans une lumière blanche. Ne sachant pas à qui faire confiance, Turner emmène Angie dans la maison rurale de son frère, où ils découvrent un étrange implant dans le cerveau d’Angie qui provoque des transes, dans lequel Angie semble canaliser les dieux vaudous.
Pendant ce temps, Marly, une ancienne galeriste parisienne, est embauchée par le milliardaire malade Josef Virek pour retrouver l’artiste qui a réalisé plusieurs collages. Elle devient de plus en plus préoccupée par Virek et son réseau d’influence, mais elle trouve l’emplacement de l’artiste, sur une station centrale abandonnée en orbite autour de la Terre. C’est une intelligence artificielle utilisant des manipulateurs et des capteurs mécaniques, et elle communique avec des IA plus petites qui existent en tant que dieux vaudous dans le cyberespace.
Dans le New Jersey, Bobby Newmark, alias Count Zero, effectue sa première course dans le cyberespace, où il est presque tué. Il découvre que les grandes entreprises recherchent le logiciel qu’il utilise et font exploser sa maison. Le logiciel était testé sur lui par des adeptes du vaudou à gros revenus, et Bobby a été sauvé par quelqu’un qu’ils appellent la Vierge. Les adeptes du vaudou amènent Bobby dans un club appelé Jammer’s pour le garder en sécurité, mais bientôt ils sont fermés par des membres de gangs. Bobby se rend dans le cyberespace et découvre que Jaylene Slide, une cybercoureuse, recherche celui qui a tué son amant lors de l’extraction ratée de Mitchell.
Turner arrive avec Angie, amenée là-bas sous la direction de dieux vaudous, qui vivent dans le cyberespace. Ils découvrent que Conroy a doublé Mitchell et qu’il travaille pour Virek. Bobby se rend dans le cyberespace pour dire à Jaylene que Conroy est le coupable, et il se retrouve face à Virek. Bobby laisse l’un des dieux vaudous le reprendre, une capacité qu’il a acquise en utilisant le logiciel illicite des IA, et tue Virek. Puis il livre Conroy à Jaylene, qui le fait tuer. Turner se retire de sa vie de mercenaire, tandis que Bobby et Angie rejoignent les adeptes du vaudou pour en savoir plus sur leur rôle. Plusieurs années plus tard, Angie est une star des médias en devenir, avec Bobby comme garde du corps.